matplotlibでboxplotの調べたことまとめ
はじめに
久しぶりです。研究やら授業でてんてこ舞いでした。
研究のためにboxplotで試行錯誤した結果のまとめを書こうと思います。
グループ化、及びbox内の塗りつぶし
普通にプロットすると、全部同じ色になってしまいます。
１つのグループに対し、複数のデータ群がある場合、同じ色だけで表現するのは非常に見難くなります。
なので、グループ毎にbox内を塗りつぶしてプロットしてみましょう。
今回は、3つの国にある、バナナ（黄色）ときゅうり（緑）の長さを例にしましょうかね、値は適当です。
from matplotlib import pyplot as plt from scipy import stats data = [] with open('./lengthData.txt', 'r') as f: for line in f.readlines(): data.append(map(int, line.split())) # テキストデータから数値に変換してdataに格納 groupData = [] for i in range(3): tmpData = [] for j in range(2): tmpData.append(data[i*2+j]) #(例えば) 3行2列の配列を作ります groupData.append(tmpData) #3サンプルそれぞれが2つのデータ群を持つ配列の完成 for i in range(3): #添字iでグループ指定、patch_artistはbox内の塗りつぶしです。 #１グループの描画 bp = plt.boxplot(groupData[i], positions=[2*i+1,2*i+2], widths=0.8, patch_artist=True) bp['boxes'][0].set_facecolor('yellow') #黄色(バナナ) plt.setp(bp['medians'][0], color='red', linewidth=2) #メディアン plt.setp(bp['caps'][0], linewidth=1.5) #はこ髭の上限の線の太さ plt.setp(bp['caps'][1], linewidth=1.5) #はこ髭の下限の線の太さ plt.setp(bp['whiskers'][0], linewidth=2) #boxから伸びる上の点線の太さ plt.setp(bp['whiskers'][1], linewidth=2) #boxから伸びる下の点線の太さ bp['boxes'][1].set_facecolor('green') #緑（きゅうり） plt.setp(bp['medians'][1], color='red', linewidth=2) plt.setp(bp['caps'][2], linewidth=1.5) #同上（添字に注意！） plt.setp(bp['caps'][3], linewidth=1.5) plt.setp(bp['whiskers'][2], linewidth=2) plt.setp(bp['whiskers'][3], linewidth=2)
レジェンドを付ける
boxplotではデフォルトでレジェンドを付けることは出来ません。
（デフォルトのプロットの色が全部同じだから）
せっかく前節で色を付けたので、レジェンドを付けてみましょう。
banana, = plt.plot([1,1], 'y-', linewidth=10) #実際に線をプロットします。 cucumber, = plt.plot([1,1], 'g-', linewidth=10) plt.legend((banana, cucumber), ('banana', 'cucumber')) #レジェンドの表示 banana.set_visible(False) #プロットした線を見えなくします。 cucumber.set_visible(False)
一度プロットしてからレジェンドを表示し、プロットした線を見えなくする、という手順です。
細かい設定
その他、プロットを見やすくするための設定です。
plt.ylim(0,40) plt.yticks([i*20 for i in range(5)], ['0','10','20','30','40'], fontsize=17) plt.ylabel('Length', fontsize=18) plt.xticks([i for i in range(8)], ['','JP', 'JP', 'US', 'US', 'UK', 'UK', ''], fontsize=20) plt.xlabel('Country', fontsize=18) plt.grid()
以上の設定でプロットしたものが以下になります。
